Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Foxd2O35392 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Foxd2O35392 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Foxd2O35392 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Foxd2O35392 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Foxd2O35392 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms