Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ColqO35348 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ColqO35348 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ColqO35348 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ColqO35348 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ColqO35348 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ColqO35348 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ColqO35348 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ColqO35348 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ColqO35348 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ColqO35348 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ColqO35348 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ColqO35348 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ColqO35348 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ColqO35348 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ColqO35348 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ColqO35348 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ColqO35348 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ColqO35348 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ColqO35348 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ColqO35348 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.1 ms