Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f3O35261 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f3O35261 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f3O35261 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f3O35261 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f3O35261 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f3O35261 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f3O35261 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f3O35261 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f3O35261 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2f3O35261 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2f3O35261 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
E2f3O35261 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2f3O35261 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f3O35261 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
E2f3O35261 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms