Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ptpn9O35239 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ptpn9O35239 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms