Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ebi3O35228 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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