Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Bhlhe40O35185 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Bhlhe40O35185 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms