Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad6O35182 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad6O35182 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad6O35182 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smad6O35182 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smad6O35182 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms