Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Polr1aO35134 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms