Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Scarb2O35114 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Scarb2O35114 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Scarb2O35114 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Scarb2O35114 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scarb2O35114 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scarb2O35114 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms