Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GclmO09172 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GclmO09172 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GclmO09172 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GclmO09172 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GclmO09172 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GclmO09172 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GclmO09172 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GclmO09172 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GclmO09172 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GclmO09172 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GclmO09172 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GclmO09172 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GclmO09172 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GclmO09172 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GclmO09172 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GclmO09172 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GclmO09172 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GclmO09172 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GclmO09172 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GclmO09172 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GclmO09172 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GclmO09172 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GclmO09172 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GclmO09172 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GclmO09172 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GclmO09172 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GclmO09172 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GclmO09172 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GclmO09172 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GclmO09172 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GclmO09172 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GclmO09172 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GclmO09172 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GclmO09172 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GclmO09172 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GclmO09172 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GclmO09172 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GclmO09172 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GclmO09172 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GclmO09172 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GclmO09172 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GclmO09172 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GclmO09172 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GclmO09172 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GclmO09172 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GclmO09172 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GclmO09172 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GclmO09172 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GclmO09172 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GclmO09172 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GclmO09172 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GclmO09172 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GclmO09172 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GclmO09172 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GclmO09172 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GclmO09172 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GclmO09172 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GclmO09172 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GclmO09172 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GclmO09172 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GclmO09172 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GclmO09172 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GclmO09172 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GclmO09172 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GclmO09172 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GclmO09172 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GclmO09172 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GclmO09172 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GclmO09172 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms