Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LhbO09108 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LhbO09108 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LhbO09108 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LhbO09108 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LhbO09108 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LhbO09108 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LhbO09108 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LhbO09108 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LhbO09108 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LhbO09108 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LhbO09108 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LhbO09108 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LhbO09108 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LhbO09108 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LhbO09108 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LhbO09108 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms