Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gfra2O08842 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gfra2O08842 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms