Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eftud2O08810 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eftud2O08810 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms