Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MttpO08601 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MttpO08601 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MttpO08601 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MttpO08601 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MttpO08601 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MttpO08601 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MttpO08601 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MttpO08601 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MttpO08601 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MttpO08601 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MttpO08601 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MttpO08601 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MttpO08601 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MttpO08601 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MttpO08601 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MttpO08601 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms