Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CltaO08585 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CltaO08585 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CltaO08585 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CltaO08585 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CltaO08585 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltaO08585 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltaO08585 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltaO08585 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltaO08585 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltaO08585 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltaO08585 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltaO08585 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltaO08585 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CltaO08585 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CltaO08585 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CltaO08585 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CltaO08585 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CltaO08585 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CltaO08585 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltaO08585 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltaO08585 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltaO08585 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltaO08585 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltaO08585 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltaO08585 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltaO08585 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltaO08585 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CltaO08585 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CltaO08585 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltaO08585 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltaO08585 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltaO08585 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltaO08585 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CltaO08585 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltaO08585 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltaO08585 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CltaO08585 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltaO08585 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltaO08585 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltaO08585 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CltaO08585 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltaO08585 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltaO08585 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltaO08585 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltaO08585 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltaO08585 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CltaO08585 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CltaO08585 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms