Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
U90926O08546 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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U90926O08546 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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U90926O08546 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
U90926O08546 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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U90926O08546 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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U90926O08546 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
U90926O08546 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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U90926O08546 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
U90926O08546 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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