Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm8050L7N2E3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms