Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm20939L7N243 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm20939L7N243 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms