Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r80L7N1Z3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r80L7N1Z3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms