Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IfnabL7MTU6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IfnabL7MTU6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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