Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Gm379J3QQ19 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm379J3QQ19 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm379J3QQ19 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm379J3QQ19 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Gm379J3QQ19 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Gm379J3QQ19 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm379J3QQ19 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm379J3QQ19 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm379J3QQ19 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm379J3QQ19 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm379J3QQ19 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm379J3QQ19 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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