Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm2056J3QQ02 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms