Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shisa8J3QNX5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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