Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calhm3J3QMI4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Calhm3J3QMI4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms