Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20834J3QM72 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm20834J3QM72 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms