Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm20825J3QM67 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm20825J3QM67 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms