Protein–RNA interactions for Protein: J3QJV4

Gm19402, MCG61404, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19402J3QJV4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm19402J3QJV4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm19402J3QJV4 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm19402J3QJV4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm19402J3QJV4 Arhgap6-202ENSMUST00000087016 1310 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm19402J3QJV4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm19402J3QJV4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm19402J3QJV4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm19402J3QJV4 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm19402J3QJV4 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm19402J3QJV4 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm19402J3QJV4 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm19402J3QJV4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms