Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21411J3KMS0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21411J3KMS0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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