Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AK157302I3ITR1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AK157302I3ITR1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms