Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cldn20G5E8X0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cldn20G5E8X0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cldn20G5E8X0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn20G5E8X0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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