Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HrcG5E8J6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
HrcG5E8J6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HrcG5E8J6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HrcG5E8J6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms