Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vmn1r12G5E8G1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vmn1r12G5E8G1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms