Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r58G3X9U3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r58G3X9U3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms