Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnf148G3X9R7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf148G3X9R7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms