Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arfgef1G3X9K3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arfgef1G3X9K3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms