Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer4cG3UXD1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Speer4cG3UXD1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms