Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
XntrpcF8VQM8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms