Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Srp72F8VQC1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Srp72F8VQC1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms