Protein–RNA interactions for Protein: F7BE84

Ankrd50, Ankyrin repeat domain 50 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd50F7BE84 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ankrd50F7BE84 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd50F7BE84 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms