Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Gm20538F6Z9R1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms