Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm6482F6YHC1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms