Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm10378F6XQQ1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Gm10378F6XQQ1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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Gm10378F6XQQ1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Gm10378F6XQQ1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Gm10378F6XQQ1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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Gm10378F6XQQ1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Gm10378F6XQQ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Gm10378F6XQQ1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm10378F6XQQ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Gm10378F6XQQ1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms