Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Zfp988F6VKC7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Zfp988F6VKC7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Zfp988F6VKC7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Zfp988F6VKC7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Zfp988F6VKC7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Zfp988F6VKC7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Zfp988F6VKC7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Zfp988F6VKC7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Zfp988F6VKC7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp988F6VKC7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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