Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm340F6RGI3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm340F6RGI3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.8 ms