Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rnf165E9QAU8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rnf165E9QAU8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rnf165E9QAU8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf165E9QAU8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf165E9QAU8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf165E9QAU8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf165E9QAU8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf165E9QAU8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Rnf165E9QAU8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf165E9QAU8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf165E9QAU8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf165E9QAU8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf165E9QAU8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Rnf165E9QAU8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf165E9QAU8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf165E9QAU8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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