Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pik3c2bE9QAN8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms