Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cald1E9QA15 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cald1E9QA15 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms