Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Gm5407E9Q7Q1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm5407E9Q7Q1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5407E9Q7Q1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm5407E9Q7Q1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Gm5407E9Q7Q1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm5407E9Q7Q1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm5407E9Q7Q1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm5407E9Q7Q1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm5407E9Q7Q1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Gm5407E9Q7Q1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm5407E9Q7Q1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm5407E9Q7Q1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm5407E9Q7Q1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm5407E9Q7Q1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm5407E9Q7Q1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm5407E9Q7Q1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gm5407E9Q7Q1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5407E9Q7Q1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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