Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DspE9Q557 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DspE9Q557 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DspE9Q557 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DspE9Q557 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DspE9Q557 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DspE9Q557 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DspE9Q557 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DspE9Q557 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DspE9Q557 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DspE9Q557 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DspE9Q557 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DspE9Q557 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DspE9Q557 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms