Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20518E9Q548 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20518E9Q548 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms